胃肠道功能受神经调节和体液调节。胃肠道平滑肌受副交感神经和交感神经的双重支配。副交感神经对胃肠的运动和分泌起兴奋作用，交感神经兴奋的效应是抑制胃肠运动和分泌。从食管至肛门的消化道拥有内在的神经系统，也叫壁内神经丛，由位于纵行肌和环行肌之间的肌间神经丛和位于黏膜下的黏膜下神经丛构成。大部分副交感神经和交感神经与壁内神经元形成突触联系。