川崎病为自限性疾病，多数预后良好，未经治疗的患儿，并发冠状动脉瘤者可达20%～25%；自大剂量IVIG应用于本病后，冠状动脉病变发生率已大幅度下降至2%～8%。巨型冠状动脉瘤预后不良，常因冠脉狭窄、血栓形成并发心肌梗死或冠状动脉瘤发生破裂导致猝死，病死率约0.5%。在1～2年内应定期复查心电图和超声心动图。