在临床诊断基础上，痰细菌定量培养分离病原菌数106cfu/ml即可诊断。经纤维支气管镜或人工气道吸引采集的下呼吸道分泌物病原菌数105cfu/ml；支气管肺泡灌洗分离到的病原菌数≥104cfu/ml；经防污染标本刷或防污染肺泡灌洗采集的下呼吸道分泌物分离到病原菌，而原有慢性阻塞性肺病包括支气管扩张者病原菌数必须≥103cfu/ml方可进行下呼吸道医院感染的病原学诊断。